Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3020E9Q3J7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3020E9Q3J7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms