Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfap46E9Q2C0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfap46E9Q2C0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms