Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3250E9Q1M3 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms