Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5cE9Q1F5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5cE9Q1F5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5cE9Q1F5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5cE9Q1F5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Myo5cE9Q1F5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myo5cE9Q1F5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms