Protein–RNA interactions for Protein: E9PXX9

Slc28a1, Sodium/nucleoside cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a1E9PXX9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a1E9PXX9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a1E9PXX9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a1E9PXX9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a1E9PXX9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a1E9PXX9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a1E9PXX9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a1E9PXX9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a1E9PXX9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a1E9PXX9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a1E9PXX9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc28a1E9PXX9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a1E9PXX9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms