Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sfta2E9PXB6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms