Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms