Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gcn1E9PVA8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gcn1E9PVA8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gcn1E9PVA8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gcn1E9PVA8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gcn1E9PVA8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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