Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FgaE9PV24 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms