Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm5478D3Z6R0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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