Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms