Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cttnbp2B9EJA2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms