Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms