Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol6B7ZC55 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms