Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms