Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms