Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms