Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap58B2RW38 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfap58B2RW38 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms