Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms