Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usf3B2RUQ2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms