Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms