Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms