Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms