Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms