Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Samt1A2BED8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Samt1A2BED8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Samt1A2BED8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Samt1A2BED8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Samt1A2BED8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Samt1A2BED8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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