Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Patl2A2ARM1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Patl2A2ARM1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Patl2A2ARM1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms