Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem185aA2AF53 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms