Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms