Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms