Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms