Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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