Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv19A0A0B4J1H4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms