Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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