Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms