Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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