Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B657

Trdv1, T cell receptor delta variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv1A0A075B657 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trdv1A0A075B657 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trdv1A0A075B657 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trdv1A0A075B657 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trdv1A0A075B657 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv1A0A075B657 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trdv1A0A075B657 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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