Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms