Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpreP49446 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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PtpreP49446 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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PtpreP49446 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PtpreP49446 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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PtpreP49446 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PtpreP49446 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PtpreP49446 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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PtpreP49446 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtpreP49446 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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