Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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