Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm379J3QQ19 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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Gm379J3QQ19 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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Gm379J3QQ19 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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Gm379J3QQ19 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm379J3QQ19 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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