Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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Trim35Q8C006 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim35Q8C006 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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