Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms