Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms