Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcniQ9Z2V9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms