Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms