Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2aQ9Z255 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms