Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shcbp1Q9Z179 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms