Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dctn3Q9Z0Y1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dctn3Q9Z0Y1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms