Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx1Q9WV80 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms