Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FarsbQ9WUA2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FarsbQ9WUA2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FarsbQ9WUA2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FarsbQ9WUA2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FarsbQ9WUA2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FarsbQ9WUA2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FarsbQ9WUA2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FarsbQ9WUA2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FarsbQ9WUA2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FarsbQ9WUA2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FarsbQ9WUA2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FarsbQ9WUA2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms